1989年台灣省住都局計劃在八里地區興建污水處理廠，建廠的工程將完全毀壞十三行遺址，經考古學者大力呼籲及社會大眾的支持，內政部決議進行搶救發掘，並於1992年將十三行遺址指定為二級古蹟，成立遺址保存區，即十三行遺址現地展示區。位於八里污水處理廠區內距離本館約七百五十公尺，佔地約三千平方公尺。

　　因十三行遺址位處砂土區，容易塌陷，1992年在成立保存區時，即特地於保存區上覆蓋其他十三行區域的棄土，並在四周設立鋼板樁，保護並確立遺址的範圍。\r

　　自2001年起，台北縣政府文化局以及十三行博物館在獲得內政部補助後，即針對此區著手進行整體規劃，舖設人行步道、設置解說牌，進行鋼板樁防繡美化等，讓民眾得以親自站在十三行遺址上，認識遺址，想像十三行人的生活情形，從而瞭解文化資產的重要性。

　　位於十三行博物館旁，屬於八里左岸改造工程的一部分，園內有自行車道與左岸的自行車道相連接，而渡船頭、左岸公園、水筆仔公園、挖仔尾自然保留區、到十三行博物館、十三行文化公園，八里的遊憩點已連成一線，足夠規劃一日遊行程，不想開車的民眾，可選擇由捷運關渡站、淡水站搭乘紅13線公車，或是在淡水渡船頭搭乘渡船前來，各個景點都有紅13線公車停靠。

　　目前十三行文化公園至2006年5月尚未對外開放,請安排此景點行程遊客注意正式對外開放時間，以免白跑一趟。

博物館路上顯目的路標

大眾交通:
*捷運淡水站 → 渡船 → 左岸公園站紅13路接駁公車
　→ 十三行文化公園

*捷運淡水站 → 渡船 → 騎自行車約4公里 → 十三行文化公園

*捷運關渡站 → 紅13路接駁公車 → 十三行文化公園

自行開車：
關渡大橋 → 台十五線八里方向 → 中華路 → 文昌路 → 博物館路 → 十三行文化公園

大門入口處